リアの沈み込みについて - コルト

コルト1,3RX　z21Aに一年ほど前から乗っています。
色々車に手を加えている中で、トランクにオーディオボックスを載せてからリアのサスペンションの沈み込みが激しく、ノーマルサスペンションなのにフェンダーとのクリアランスが非常に狭くなってしまいました。
その結果走行中道路の凹凸でタイヤとフェンダー爪が干渉してしまいます。
過去に乗っていた車が全てマルチリンクだった為、今回初のリアアクスルなので、勝手が分からず質問します。
対策として、フェンダー爪折りで行かなければならないのか、それとも車高調で足まわりのバネレートを上げた上、社交を高めに設定すれば何とかなるのか？
同じようにリアに重量物を常に積載されている方のアドバイスを頂けると助かります。
尚、現在のリア周りはバージョンRのオーバーフェンダーを装置しておりホイールが17-6,5J＋45 スペーサー5mm タイヤは215-40R17です。
宜しくお願い致します。